78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_2323 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_2323  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  178  1e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0002  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 88 bp  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.320544  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0134  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 85 bp  99.6  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.756856  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2234  tRNA-Ser  97.83 
 
 		 90 bp  83.8  0.000000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0056  tRNA-Ser  95.35 
 
 		 91 bp  69.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607701  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0002  tRNA-Ser  95.35 
 
 		 91 bp  69.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00130042  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  97.37 
 
 		 88 bp  67.9  0.0000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.602947  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1765  tRNA-Ser  97.37 
 
 		 88 bp  67.9  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.393275  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2089  tRNA-Ser  97.37 
 
 		 88 bp  67.9  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.835616  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3166t  tRNA-Ser  87.14 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.197881  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0048  tRNA-Ser  88.46 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0798542  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0047  tRNA-Ser  88.46 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0006  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.22052e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0006  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  97.06 
 
 		 91 bp  60  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.179799  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0141  tRNA-Ser  92.86 
 
 		 88 bp  60  0.00000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4596  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0064  tRNA-Ser  94.59 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tSer01  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 93 bp  58  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0568907  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0062  tRNA-Ser  94.59 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.633699 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0034  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 91 bp  56  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0050  tRNA-Ser  85.29 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.628519  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1364  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  90.91 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.250098  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0007  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0169683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2774  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.12292  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04530  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.303031  normal  0.07409 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0005  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.64663 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tSer03  tRNA-Ser  87.32 
 
 		 93 bp  54  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.666732 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0064  tRNA-Ser  84.29 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.019452  normal  0.0125839 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0035  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.802654  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0041  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.589584  normal  0.364354 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0044  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0213479 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0049  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0048  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0101109  normal  0.0876341 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0073  tRNA-Ser  84.29 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000286061  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0024  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01622  tRNA-Ser  84.29 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0040  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0047  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.327618  normal  0.0398256 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna125  tRNA-Ser  84.29 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.714037  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1356  tRNA-Ser  84.29 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00596474  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0088  tRNA-Ser  86.79 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.632299  hitchhiker  0.00150076 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0008  tRNA-Ser  88.64 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.16929  normal  0.203925 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60240  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268246  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27190  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000521392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0033  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56325  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt11  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644598  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0053  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0980928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0012  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0067  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0046  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0056  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.133866  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t28  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0189168  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0008  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA35  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.189455  normal  0.46537 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R29  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.274063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0059  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00383957  normal  0.0396852 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0027  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.5818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0008  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0042  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.121503  normal  0.0171671 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1009  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14042  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.417053 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0060  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2302  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000177345  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0025  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00148437  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0911  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.531015  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0055  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0054  tRNA-Ser  86.27 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.40887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0040  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.140248 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0033  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0034  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.355586  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna37  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0060  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.948635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0057  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0032  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0029  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23919  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0047  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0212707  normal  0.0426305 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>