21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_R0010 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_R0010  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  178  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0011  tRNA-Ser  98.86 
 
 		 90 bp  167  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0054  tRNA-Ser  97.78 
 
 		 91 bp  81.8  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03320  tRNA-Ser  86.81 
 
 		 91 bp  77.8  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0009  tRNA-Ser  85.88 
 
 		 90 bp  73.8  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03510  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.608877  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0007  tRNA-Ser  95.12 
 
 		 91 bp  65.9  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0004  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26020  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.16929  normal  0.203925 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0059  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00383957  normal  0.0396852 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0005  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.183789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0010  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 88 bp  48.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0008  tRNA-Ser  82.76 
 
 		 85 bp  48.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.602453  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0027  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.796709  normal  0.0348643 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36870  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.339206  normal  0.059876 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1916  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0029  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0040  tRNA-Cys  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000925969  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.033813  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0016  tRNA-Ser  86 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000309331  unclonable  0.0000000000000213015 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>