43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_R0066 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_R0066  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0002  tRNA-Ser  91.76 
 
 		 88 bp  113  7.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0076  tRNA-Ser  91.95 
 
 		 87 bp  101  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0053  tRNA-Ser  91.95 
 
 		 90 bp  101  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308091 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0008  tRNA-Ser  91.95 
 
 		 90 bp  101  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0060  tRNA-Ser  90.8 
 
 		 90 bp  93.7  6e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0089  tRNA-Ser  90.8 
 
 		 90 bp  93.7  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0062  tRNA-Ser  85.88 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0010  tRNA-Ser  87.5 
 
 		 88 bp  71.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36870  tRNA-Ser  87.69 
 
 		 88 bp  65.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.339206  normal  0.059876 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0008  tRNA-Ser  86.11 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.602453  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0059  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.826409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0059  tRNA-Ser  86.15 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00383957  normal  0.0396852 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0007  tRNA-Ser  88.06 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0169683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0007  tRNA-Ser  88.06 
 
 		 90 bp  54  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0006  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.226998  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0075  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0052  tRNA-Ser  86.44 
 
 		 91 bp  50.1  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.258568  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0005  tRNA-Ser  85.07 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.64663 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0008  tRNA-Ser  86.57 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.16929  normal  0.203925 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0072  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04530  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.303031  normal  0.07409 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0055  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.223526  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0009  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0061  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03320  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0054  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.40887  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lplt13  tRNA-Ser  83.87 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0004  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0054  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.144676  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0007  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0040  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0721486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0010  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.677549  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0009  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0053  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.256753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02690  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.599018  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0009  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_010085  NMAR_2  tRNA-OTHER  100 
 
 		 124 bp  44.1  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.114787 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0008  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0038  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lppt13  tRNA-Ser  83.87 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0009  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0055  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0814069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>