15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_R0047 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_R0047  tRNA-Cys  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0014  tRNA-Cys  91.78 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000003248  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0040  tRNA-Cys  86.3 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000925969  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0046  tRNA-Cys  86.11 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.262416  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0046  tRNA-Cys  86.11 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0050  tRNA-Cys  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000040729  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0061  tRNA-Cys  91.89 
 
 		 78 bp  50.1  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.478653  normal  0.063313 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0065  tRNA-Cys  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.877098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0002  tRNA-Cys  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150631  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0007  tRNA-Cys  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0824294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0022  tRNA-Cys  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000019175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0064  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0043  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000207344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0013  tRNA-Cys  86 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00140288  normal  0.708888 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26110  tRNA-Ser  100 
 
 		 95 bp  44.1  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>