21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_R0007 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_R0007  tRNA-Cys  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0824294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0001  tRNA-Cys  90.91 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.364901  hitchhiker  0.00165613 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0050  tRNA-Cys  90.32 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000040729  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0816  tRNA-Cys  91.07 
 
 		 71 bp  63.9  0.000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.713516  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0013  tRNA-Cys  87.93 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00140288  normal  0.708888 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0535  tRNA-Cys  96.88 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0045  tRNA-Cys  92.11 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.364336  normal  0.716985 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0061  tRNA-Cys  88.89 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.478653  normal  0.063313 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0047  tRNA-Cys  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0038  tRNA-Cys  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000123797  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000388055  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0037  tRNA-Cys  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0030  tRNA-Cys  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000038111  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0065  tRNA-Cys  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.758195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0018  tRNA-Cys  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0048  tRNA-Cys  84.48 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.151356  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0046  tRNA-Cys  83.12 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0059  tRNA-Cys  86 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000068081  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0046  tRNA-Cys  83.12 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.262416  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0040  tRNA-Cys  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.700451 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1591  tRNA-Cys  89.47 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0177863  normal  0.766163 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>