20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_R0046 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_R0046  tRNA-Cys  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0046  tRNA-Cys  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.262416  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0040  tRNA-Cys  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000925969  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0014  tRNA-Cys  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000003248  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0047  tRNA-Cys  86.11 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0022  tRNA-Cys  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000019175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0029  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 94 bp  50.1  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.559741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0028  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.411326  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0009  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNASerVIMSS1309150  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNASerVIMSS1309074  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0015  tRNA-Met  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000488541  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0042  tRNA-Cys  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.220787  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0015  tRNA-Met  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000205808  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0007  tRNA-Cys  83.12 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0824294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0040  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000505544  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000669045  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0030  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1223  tRNA-Cys  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0426798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>