33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_R0013 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_R0013  tRNA-Cys  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00140288  normal  0.708888 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0052  tRNA-Cys  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0042  tRNA-Cys  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.815028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0001  tRNA-Cys  90.57 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.364901  hitchhiker  0.00165613 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0037  tRNA-Cys  95 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0007  tRNA-Cys  87.93 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0824294  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0024  tRNA-Cys  85.51 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0056  tRNA-Cys  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000403241  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0014  tRNA-Cys  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000913003  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0037  tRNA-Cys  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0011  tRNA-Cys  88.24 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0040  tRNA-Cys  89.36 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.700451 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0022  tRNA-Cys  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000266732  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0030  tRNA-Cys  88.89 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.512325  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0059  tRNA-Cys  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000068081  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000669045  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1223  tRNA-Cys  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0426798  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0028  tRNA-Cys  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0070  tRNA-Cys  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00415694  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0008  tRNA-Cys  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0004  tRNA-Cys  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10265 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0042  tRNA-Cys  90 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0042  tRNA-Cys  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.220787  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0535  tRNA-Cys  91.43 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0012  tRNA-Cys  93.55 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0384692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0009  tRNA-Cys  93.55 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.705692  normal  0.0935108 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0020  tRNA-Cys  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.979137  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0032  tRNA-Cys  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0030  tRNA-Cys  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000038111  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0047  tRNA-Cys  86 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0065  tRNA-Cys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.877098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0029  tRNA-Cys  89.47 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000761826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0056    100 
 
 		 359 bp  44.1  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>