26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_t0816 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_t0816  tRNA-Cys  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.713516  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0007  tRNA-Cys  91.07 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0824294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0535  tRNA-Cys  85.94 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0069  tRNA-Cys  89.36 
 
 		 71 bp  54  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5684  tRNA-Cys  87.5 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0257731  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0017  tRNA-Cys  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0538  tRNA-Cys  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.435960000000001e-32 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4764  tRNA-Cys  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000101548  hitchhiker  8.34658e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5719  tRNA-Cys  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00287559  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0613  tRNA-Cys  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000112744  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0040  tRNA-Cys  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.578047  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0040  tRNA-Cys  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  87.5 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000664876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0459686  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0650273  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0128228  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.785195  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0042  tRNA-Cys  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.217311  normal  0.0105918 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0038  tRNA-Cys  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0022  tRNA-Cys  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000266732  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0050  tRNA-Cys  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000040729  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0020  tRNA-Cys  93.55 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0214186 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0087  tRNA-Cys  86 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000500213  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0047  tRNA-Cys  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000253552  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0104  tRNA-Cys  86 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.916479  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0029  tRNA-Cys  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>