11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_R0043 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_R0043  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000207344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0037  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  143  8e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.517191  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0061  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  143  8e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.632048 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0048  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 85 bp  111  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0061  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 84 bp  87.7  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.488767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0009  tRNA-Ser  87.67 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0921241  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0034  tRNA-Ser  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184009  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26110  tRNA-Ser  100 
 
 		 95 bp  48.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0064  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0014  tRNA-Cys  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000003248  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0047  tRNA-Cys  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>