12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_R0014 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_R0014  tRNA-Cys  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000003248  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0040  tRNA-Cys  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000925969  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0047  tRNA-Cys  91.78 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0046  tRNA-Cys  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.262416  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0046  tRNA-Cys  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0056  tRNA-Cys  84.42 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000403241  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0037  tRNA-Cys  84.42 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0014  tRNA-Cys  84.42 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000913003  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0022  tRNA-Cys  87.5 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000019175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0064  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0043  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000207344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26110  tRNA-Ser  100 
 
 		 95 bp  46.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>