119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0532 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0532  tRNA-Ser  100 
 
 		 95 bp  188  2e-46  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.936136  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0057  tRNA-Ser  95.56 
 
 		 90 bp  73.8  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154466  normal  0.0269773 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0032  tRNA-Ser  97.44 
 
 		 90 bp  69.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.945587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0004  tRNA-Ser  97.37 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.888303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0020  tRNA-Ser  95.12 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.437466  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0051    95 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0015  tRNA-Ser  95 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0069  tRNA-Ser  95 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.234081 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0023  tRNA-Ser  95 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.928958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0059  tRNA-Ser  95 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00925485  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA6  tRNA-Ser  95 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0471  tRNA-Ser  95 
 
 		 92 bp  63.9  0.000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1742  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 90 bp  60  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0902657  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt11  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 90 bp  60  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644598  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0067  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 90 bp  60  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0911  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 90 bp  60  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.531015  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1009  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 92 bp  60  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0060  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 90 bp  60  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0025  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 90 bp  60  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00148437  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0027  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 90 bp  60  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.5818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0015  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 90 bp  60  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0008  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 90 bp  60  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0040  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 90 bp  60  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.140248 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0014  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 90 bp  60  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.359735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0016  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 90 bp  60  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266045  normal  0.745909 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0057  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 90 bp  60  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0017  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 90 bp  60  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0033  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 90 bp  60  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56325  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0016  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 91 bp  60  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0014  tRNA-Ser  93.18 
 
 		 82 bp  58  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.593204  normal  0.16115 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tSer01  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 93 bp  56  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0568907  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0040  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 91 bp  56  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0006  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 91 bp  56  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0043  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 91 bp  56  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.106219  normal  0.177899 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0006  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 91 bp  56  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.22052e-25 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0033  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0031  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0145328  normal  0.103161 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0030  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.596087  normal  0.116932 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0047  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.018693  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4314  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.650713  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0017  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.576804  normal  0.691356 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0025  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.217878  normal  0.142788 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0006  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0017  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00284743  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0029  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.287395  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07713  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0034  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0025  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6042  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.516287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0064  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0008  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4596  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0062  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.633699 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.250098  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt13  tRNA-Ser  90 
 
 		 88 bp  48.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt13  tRNA-Ser  90 
 
 		 88 bp  48.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0075  tRNA-Ser  88.64 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0725432  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0002  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00130042  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0056  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607701  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0106  tRNA-Ser  88.64 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.750224  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0006  tRNA-Ser  90 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000860706  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0041  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.142753  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0051  tRNA-Ser  90 
 
 		 93 bp  48.1  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.267767  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0004  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0022  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 92 bp  46.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0088  tRNA-Ser  100 
 
 		 89 bp  46.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0007  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0015  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 90 bp  46.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109725  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tSer03  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 93 bp  46.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.666732 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27190  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000521392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0009  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0053  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451369  hitchhiker  0.000135525 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0075  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0009  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0042  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.121503  normal  0.0171671 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2302  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 92 bp  46.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000177345  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0007  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.846387  normal  0.194729 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0043  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 92 bp  46.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0613926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0054  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.40887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0009  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0041  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 91 bp  46.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.592847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0012  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0033  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 93 bp  46.1  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0034  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 93 bp  46.1  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.355586  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna37  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 93 bp  46.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0034  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0032  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 93 bp  46.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1402  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0046  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 91 bp  46.1  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0061  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60240  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268246  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.443501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0072  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0065  tRNA-Ser  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.773691 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 89 bp  46.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0037  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 93 bp  46.1  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0010  tRNA-Ser  100 
 
 		 89 bp  46.1  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.314795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0005  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.087026  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0011  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000337805  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0060  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000115188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>