24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_R0007 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_R0007  tRNA-Trp  100 
 
 		 139 bp  276  1.0000000000000001e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.249793  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0011  tRNA-Lys  100 
 
 		 96 bp  50.1  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.935376  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0040  tRNA-Arg  100 
 
 		 78 bp  50.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.913474  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0075  tRNA-Lys  96.43 
 
 		 73 bp  48.1  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0022  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0023  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000017569  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  MSED_t5  tRNA-Trp  90.7 
 
 		 132 bp  46.1  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000378916 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0023  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000859824  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0022  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0040  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13990  tRNA-Met  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.314954  normal  0.930343 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0045  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_R0078  tRNA-Met  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0983896 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_R0078  tRNA-Met  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.105047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0029  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00945673 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0374  tRNA-Met  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2383  tRNA-Met  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2524  tRNA-Met  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1714  tRNA-Met  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.199477  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1521  tRNA-Met  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0622  tRNA-Met  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_BR0007  tRNA-Met  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0832  tRNA-Met  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Met-1  tRNA-Met  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>