24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_tRNA47 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_tRNA47  tRNA-OTHER  100 
 
 		 68 bp  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.327653 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0026  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000013123  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0039  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0043  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0042  tRNA-Met  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0047  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.596916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0016  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0043  tRNA-Met  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07693  tRNA-Gly  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0034  tRNA-Asp  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0915271  hitchhiker  0.000000414345 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0084  tRNA-Lys  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0001  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0487853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0049  tRNA-Asp  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000144265  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0058  tRNA-Asp  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0017  tRNA-Thr  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0552891  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0046  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0047  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.101191  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0063  tRNA-Asp  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.453793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0038  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.418061  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0003  tRNA-Asp  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.541849 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0004  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.359644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt15  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0043  tRNA-Thr  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0022  tRNA-Arg  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>