11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_R0046 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_R0046  tRNA-Thr  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0004  tRNA-Thr  88 
 
 
72 bp  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.359644  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0016  tRNA-Thr  91.67 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000236341  hitchhiker  0.00490505 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0058  tRNA-Thr  91.67 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000341468  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0055  tRNA-Thr  91.67 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.872606 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0027  tRNA-Thr  91.67 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.557842  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0049  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.757916 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0061  tRNA-Thr  91.67 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0048  tRNA-Thr  91.43 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000219709  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0004  tRNA-Thr  91.43 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA47  tRNA-OTHER  96.15 
 
 
68 bp  44.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.327653 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>