29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_R0038 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_R0038  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.418061  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0004  tRNA-Thr  96 
 
 		 72 bp  83.8  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.359644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0028  tRNA-Thr  92 
 
 		 72 bp  67.9  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0010  tRNA-Thr  94.74 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0031  tRNA-Thr  90 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0124047 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0018  tRNA-Thr  90 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0225129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0005  tRNA-Thr  88 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0044  tRNA-Thr  88 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.353494  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0022  tRNA-Thr  89.13 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0012  tRNA-Thr  88 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0024  tRNA-Thr  88 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.699112 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0041  tRNA-Pro  100 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.83752 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0035  tRNA-Pro  100 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.877859  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0047  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.101191  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0035  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.746107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0020  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0148448 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0034  tRNA-Thr  88.37 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000000469918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0027  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0026  tRNA-Thr  88.37 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446733  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0027  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.997139  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0023  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0062  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0048  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.446269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0019  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0026  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.094878  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA47  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 68 bp  44.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.327653 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0003  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0013  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0697084  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0022  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.213128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>