20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_R0013 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_R0013  tRNA-Ala  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0697084  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0003  tRNA-Ala  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0022  tRNA-Ala  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.213128  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0010  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000307763  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0051  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13990  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.314954  normal  0.930343 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0030  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000862295  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0016  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.034253  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0055  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0036    100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.132649  normal  0.79109 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0028  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808447  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0047  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.188533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0047  tRNA-Asp  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.488675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0059  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.938712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0041  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00163216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0027  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.00000000032409  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0066  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0064  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0028  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0101867  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0038  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.418061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>