27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_R0028 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_R0028  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0101867  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0004  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.554141  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0051  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0010  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000307763  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0059  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0347498 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0041  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0057  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0004  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.557667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0071  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0022  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.836279  normal  0.0847494 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0020  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0025  tRNA-Ala  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000185989  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0006  tRNA-Ala  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0009  tRNA-Ala  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0051  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0022  tRNA-Ala  87.76 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.213128  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0050  tRNA-Ala  91.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0003  tRNA-Ala  87.76 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0045  tRNA-Ala  91.89 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0025  tRNA-Ala  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000151787  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0047  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0029  tRNA-Ala  86.79 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0013  tRNA-Ala  89.58 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0013  tRNA-Ala  89.58 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0809108  normal  0.295028 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0016  tRNA-Ala  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00130891  unclonable  0.0000000248752 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0048  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000143033  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0013  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0697084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>