46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_R0018 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_R0018  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0225129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0005  tRNA-Thr  94.44 
 
 		 72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0031  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0124047 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0022  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0028  tRNA-Thr  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0004  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 72 bp  83.8  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.359644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0048  tRNA-Thr  97.14 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.446269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0019  tRNA-Thr  97.14 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0012  tRNA-Thr  97.14 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0044  tRNA-Thr  97.14 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.353494  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0038  tRNA-Thr  90 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.418061  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0027  tRNA-Thr  96.88 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.997139  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0023  tRNA-Thr  96.88 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0027  tRNA-Thr  96.88 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0020  tRNA-Thr  96.88 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0148448 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0062  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0024  tRNA-Thr  94.29 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.699112 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0013  tRNA-Thr  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480722  hitchhiker  0.0000885703 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t064  tRNA-Thr  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0492871  hitchhiker  0.000000924528 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0145  tRNA-Thr  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0524672  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0029  tRNA-Thr  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467647 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0022  tRNA-Thr  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0018  tRNA-Thr  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000105771  hitchhiker  0.00192537 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03611  tRNA-Thr  89.13 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna090  tRNA-Thr  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00922026  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0024  tRNA-Thr  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0133  tRNA-Thr  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850923  normal  0.0129533 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2070  tRNA-Thr  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0014  tRNA-Thr  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.796812  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0113  tRNA-Thr  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0429315  hitchhiker  0.00021617 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0013  tRNA-Thr  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0025  tRNA-Thr  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000750128  normal  0.0484618 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t101  tRNA-Thr  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0028  tRNA-Thr  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.851168  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0131  tRNA-Thr  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000204709  normal  0.0765104 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0010  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0034  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000000469918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0022  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0157761 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2722  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000264941  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0123  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000054481  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0051  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0001  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0006  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000228394  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0050  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.111405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1361  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0029  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>