17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_R0012 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_R0044  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.353494  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0012  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0024  tRNA-Thr  98.61 
 
 		 72 bp  135  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.699112 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0019  tRNA-Thr  95.83 
 
 		 72 bp  119  9e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0048  tRNA-Thr  95.83 
 
 		 72 bp  119  9e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.446269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0004  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.359644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0018  tRNA-Thr  97.14 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0225129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0028  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt07  tRNA-Thr  86.44 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0038  tRNA-Thr  88 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.418061  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0020  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0148448 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0027  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0027  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.997139  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0023  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0062  tRNA-Thr  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0005  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0031  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0124047 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>