136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCAL_10 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  PCAL_10  tRNA-Lys  100 
 
 		 93 bp  184  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_4  tRNA-Lys  95.65 
 
 		 94 bp  143  8e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0532674 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_3  tRNA-Arg  93.62 
 
 		 94 bp  131  3e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0027  tRNA-Lys  100 
 
 		 77 bp  111  3e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.968088 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_7  tRNA-Arg  89.36 
 
 		 94 bp  99.6  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.010437 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_8  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 94 bp  91.7  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_6  tRNA-Arg  88.17 
 
 		 94 bp  89.7  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0008  tRNA-Lys  94.83 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0194876  normal  0.882608 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_0  tRNA-Arg  94.34 
 
 		 94 bp  81.8  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0034  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0021  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.360576 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0035  tRNA-Asn  92.59 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0036  tRNA-OTHER  100 
 
 		 99 bp  73.8  0.000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0003  tRNA-Arg  91.38 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.79204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0012  tRNA-Lys  93.48 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.711012  normal  0.109612 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0012  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0010  tRNA-Lys  95 
 
 		 97 bp  63.9  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0001  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 79 bp  63.9  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.651067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0037  tRNA-Asn  90.91 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0011  tRNA-OTHER  100 
 
 		 119 bp  60  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0012  tRNA-Trp  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.146642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0032  tRNA-Trp  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.262491 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0011  tRNA-Lys  92.5 
 
 		 96 bp  56  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.935376  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_5  tRNA-Asn  93.02 
 
 		 111 bp  54  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0006  tRNA-Trp  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.576658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0025  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 78 bp  50.1  0.00009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.954082 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0013  tRNA-Trp  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0011  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.597618  normal  0.106894 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0043  tRNA-Met  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.259921  normal  0.901297 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0009  tRNA-Arg  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122464  normal  0.0281964 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0252  tRNA-Met  86.27 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0008  tRNA-Arg  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0006  tRNA-Arg  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0026  tRNA-OTHER  96.3 
 
 		 101 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0033  tRNA-OTHER  96.77 
 
 		 98 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAArgVIMSS1309273  tRNA-Arg  86.27 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0055  tRNA-Met  86.27 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0266099  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0034  tRNA-Met  88.37 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0008  tRNA-Arg  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0005  tRNA-OTHER  96.77 
 
 		 98 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0026  tRNA-Lys  96.3 
 
 		 101 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.371557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0035  tRNA-Trp  93.55 
 
 		 94 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.138345  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00051  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00052  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00053  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00057  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0017  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.687744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0018  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0019  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.69794  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t20  tRNA-Met  86.96 
 
 		 74 bp  44.1  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t21  tRNA-Met  86.96 
 
 		 74 bp  44.1  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.929241  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t22  tRNA-Met  86.96 
 
 		 74 bp  44.1  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lppt41  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt41  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0030  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113286  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0017  tRNA-Arg  85.19 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0046  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.918384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0082  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0007  tRNA-Trp  93.33 
 
 		 112 bp  44.1  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.31683  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0081  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0120643  normal  0.12492 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0036  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.706305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0037  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.306367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0038  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.161096  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0044  tRNA-Met  86.96 
 
 		 74 bp  44.1  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4212  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353774  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4213  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.355481  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4214  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4276  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000119762  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00106  tRNA-Met  86.96 
 
 		 74 bp  44.1  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00110  tRNA-Met  86.96 
 
 		 74 bp  44.1  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4693  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.83874  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4694  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4695  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4696  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4700  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00322718  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5064  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.133339  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5065  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.133786  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5066  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.126908  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5071  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102189  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0026  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116452  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0087  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00788985  hitchhiker  0.000000411108 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0088  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0282515  hitchhiker  0.000000388022 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0089  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0276092  hitchhiker  0.00000375071 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3226  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0172509  normal  0.439997 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3227  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0186102  normal  0.434912 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3990  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000448395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0085  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.248101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0086  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.325929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0087  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0052  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00733518  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0080  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0693639  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0081  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0699076  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0082  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0688432  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0013  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000085866 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0019  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0020  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0021  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2955  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.14009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2956  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.211186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3467  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.139541  normal  0.865403 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>