170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ecaj_R0001 on replicon NC_007354
Organism: Ehrlichia canis str. Jake



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007354  Ecaj_R0001  tRNA-Arg  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0019  tRNA-Arg  94.59 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0042  tRNA-Arg  88.46 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000705596  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0042  tRNA-Arg  88.46 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0049  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2520  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00150959  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2523  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000187168  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2531  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000000138552  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2622  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.130874  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2224  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000681563  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2227  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000134564  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2235  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000178277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2308  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00164711  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  87.84 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0034  tRNA-Arg  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000649431  normal  0.612549 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0040  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000422727  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0088  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.706466  normal  0.421027 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0003  tRNA-Arg  86.11 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.79204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0038  tRNA-Arg  86.84 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000250994  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0067  tRNA-Arg  88.71 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0325  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.924352  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS05228  tRNA-Arg  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.578717  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0034  tRNA-Arg  92.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.193658  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0030  tRNA-Arg  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220532  normal  0.0165224 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0026  tRNA-Arg  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.863353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tArg02  tRNA-Arg  87.69 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0581  tRNA-Arg  87.69 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.162856  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1467  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0022  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.189189 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1760  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0040  tRNA-Arg  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2039  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000359807  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0052  tRNA-Arg  86.11 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000819113  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0844  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.998646  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0016  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.625219  normal  0.104037 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0042  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0118555  normal  0.877407 
 
 
-
 
NC_002950  PGt34  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0048  tRNA-Arg  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0050  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000128438 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0010  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000187587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t39  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107973  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0046  tRNA-Arg  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712276  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0007  tRNA-Gly  88.14 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000198503  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0046  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177541  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0052  tRNA-Arg  89.36 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280732  normal  0.142339 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0020  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000000806008  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0031  tRNA-Arg  85.92 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000138998  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0027  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.360005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0045  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000300165  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0032  tRNA-Arg  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.151331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0033  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.974847  normal  0.895856 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0048  tRNA-Arg  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0041  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000701691  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  87.1 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0473563  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t45  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0584269  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA31  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.977486  normal  0.953507 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0064  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00190165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0034  tRNA-Arg  87.1 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000100399  hitchhiker  0.00520953 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0008  tRNA-Arg  84.62 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0013  tRNA-Arg  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0934099  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0037  tRNA-Arg  86.89 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.462586  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0770  tRNA-Arg  87.93 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.595906  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0055  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2987  ABC transporter related  100 
 
 		 1668 bp  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223105 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0046  tRNA-Arg  87.1 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000649566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0046  tRNA-Arg  86.36 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.497461 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  94.59 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0091  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000502507  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tArg04  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 80 bp  50.1  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0364203  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0035  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1682  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.788721  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0088  tRNA-Arg  86.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  6.56142e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0101  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAArgVIMSS1309129  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.751283  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0010  tRNA-Val  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.41127  normal  0.578821 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0116  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000040989  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0023  tRNA-Arg  85 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.45343  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.465736  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0063  tRNA-Arg  94.44 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540821  normal  0.0441285 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0051  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.110846 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R55  tRNA-Arg  94.44 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0003  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.972856  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0026  tRNA-Arg  92.5 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000798043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0013  tRNA-Arg  84.72 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.249758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0064  tRNA-Arg  84.72 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294983  normal  0.0656653 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41340  tRNA-Arg  94.44 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.383585 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0034  tRNA-Arg  94.44 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.299722  normal  0.0234425 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0068  tRNA-Arg  84.72 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.754645  normal  0.377618 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0062  tRNA-Arg  85.94 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0906817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0058  tRNA-Arg  84.72 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0040  tRNA-Arg  94.44 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.138426 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_7  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 94 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.010437 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0005  tRNA-OTHER  87.5 
 
 		 98 bp  48.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0008  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.119735  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0012  tRNA-Arg  83.33 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0039  tRNA-Arg  94.44 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.247045  normal  0.262143 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0027  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0059  tRNA-Arg  94.44 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413322 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0028  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.402062  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>