More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_tRNAArgVIMSS1309129 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_tRNAArgVIMSS1309129  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.751283  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAArgVIMSS1309170  tRNA-Arg  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.269731  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0023  tRNA-Arg  96.72 
 
 		 74 bp  105  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.601001  normal  0.725234 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0064  tRNA-Arg  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0020  tRNA-Arg  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0247478  normal  0.430055 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0012  tRNA-Arg  95 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0409907  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAArgVIMSS1309268  tRNA-Arg  95 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.292305 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAArgVIMSS1309209  tRNA-Arg  95 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0029  tRNA-Arg  93.65 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.179908  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAArgVIMSS1309097  tRNA-Arg  93.65 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAArgVIMSS1309379  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 74 bp  89.7  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0734599  normal  0.0320984 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tArg04  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 80 bp  89.7  8e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0364203  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tArg02  tRNA-Arg  94.55 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0029  tRNA-Arg  97.78 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2520  tRNA-Arg  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00150959  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2523  tRNA-Arg  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000187168  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2531  tRNA-Arg  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000000138552  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2622  tRNA-Arg  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.130874  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2224  tRNA-Arg  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000681563  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2227  tRNA-Arg  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000134564  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2235  tRNA-Arg  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000178277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2308  tRNA-Arg  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00164711  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0052  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280732  normal  0.142339 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0770  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.595906  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  92.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0167609  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_654  tRNA-Arg  92.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.026244  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0050  tRNA-Arg  97.62 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0016  tRNA-Arg  91.38 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000516971  normal  0.0942255 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2039  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000359807  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.578717  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0019  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0034  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0049  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000247527  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1467  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0027  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000775321  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0075  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000307133  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1760  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0599  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000676837 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0027  tRNA-Arg  97.44 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0275955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0602  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.921994  normal  0.0915325 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0664  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.294078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4570  tRNA-Arg  97.44 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.188546  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0606  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0764025 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0325  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.924352  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0055  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0600  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.775158  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0044  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0027  tRNA-Arg  97.44 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.005  hitchhiker  0.000281231 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0026  tRNA-Arg  97.44 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.423722 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1167  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.394373 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2498  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000280083  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1769  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000113481  normal  0.0122655 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2907  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000134829  hitchhiker  0.0000000000437097 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1603  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0057  tRNA-Arg  97.3 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0021  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000548378  normal  0.148026 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0057  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0067  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0031  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000138998  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0016  tRNA-Arg  95 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0047026  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1682  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.788721  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0015  tRNA-Arg  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000291538  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0037  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0061  tRNA-Arg  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.204064  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3789  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.966452  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0040  tRNA-Arg  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1282  tRNA-Arg  89.09 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000513688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2297  tRNA-Arg  89.09 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00877192  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0042  tRNA-Arg  93.02 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000705596  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1396  tRNA-Arg  89.09 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00150551  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4261  tRNA-Arg  89.09 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000175716  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0028  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221183 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3177t  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.375057  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0042  tRNA-Arg  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155325  normal  0.0810865 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6039  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.406085  normal  0.551037 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0040  tRNA-Arg  91.3 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.849707  normal  0.98393 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0061  tRNA-Val  87.88 
 
 		 78 bp  60  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.304237  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3216  tRNA-Arg  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.415947  hitchhiker  0.00933438 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0048  tRNA-Arg  91.3 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185518  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2213  tRNA-Arg  97.06 
 
 		 79 bp  60  0.00000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.140545  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0034  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.193658  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2192  tRNA-Arg  87.93 
 
 		 79 bp  60  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000430612  hitchhiker  0.000000134605 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0040  tRNA-Arg  91.3 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3534  tRNA-Arg  87.93 
 
 		 79 bp  60  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00384418  hitchhiker  0.000000731088 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0025  tRNA-Arg  91.3 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0135178  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0116  tRNA-Arg  97.06 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000040989  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0040  tRNA-Arg  91.3 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.435782  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2794  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 79 bp  60  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0038  tRNA-Arg  91.3 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00706583  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0060  tRNA-Val  87.88 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.206205  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2138  tRNA-Arg  97.06 
 
 		 79 bp  60  0.00000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0224464  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2262  tRNA-Arg  87.93 
 
 		 79 bp  60  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.54251  hitchhiker  0.00000000419015 
 
 
-
 
NC_002950  PGt45  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  94.59 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000104692  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0036  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.121176  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0041  tRNA-Arg  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000701691  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tAla02  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.970472 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0016  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.367308  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0010  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.870532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>