299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_R0075 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_R0075  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000307133  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3177t  tRNA-Arg  94.92 
 
 
74 bp  93.7  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.375057  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0023  tRNA-Arg  94.64 
 
 
74 bp  87.7  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.601001  normal  0.725234 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0027  tRNA-Arg  92.98 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0275955  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0046  tRNA-Arg  92.98 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000649566  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0027  tRNA-Arg  92.98 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.005  hitchhiker  0.000281231 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0070  tRNA-Arg  92.98 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000571368  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t13672  tRNA-Arg  92.98 
 
 
74 bp  81.8  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.126339  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0026  tRNA-Arg  92.98 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.423722 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4570  tRNA-Arg  92.98 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.188546  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAArgVIMSS1309268  tRNA-Arg  92.86 
 
 
74 bp  79.8  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.292305 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t096  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000747728  normal  0.0921402 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0039  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000965131  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t025  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0049  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000822334  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0029  tRNA-Arg  91.23 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.179908  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0086  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221106  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0004  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.979842 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0027  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000223271  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAArgVIMSS1309097  tRNA-Arg  91.23 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0028  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000331563  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0057  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAArgVIMSS1309379  tRNA-Arg  91.23 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0734599  normal  0.0320984 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0086  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000450897  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAArgVIMSS1309170  tRNA-Arg  91.07 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.269731  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAArgVIMSS1309129  tRNA-Arg  91.07 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.751283  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t083  tRNA-Arg  89.83 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t087  tRNA-Arg  89.83 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t088  tRNA-Arg  89.83 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t089  tRNA-Arg  89.83 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0029  tRNA-Arg  95.35 
 
 
74 bp  69.9  0.00000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0059  tRNA-Arg  89.83 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000542339  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0065  tRNA-Arg  89.83 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00979442  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0006  tRNA-Lys  90.48 
 
 
73 bp  69.9  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0048  tRNA-Arg  89.83 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000451917  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0046  tRNA-Arg  89.83 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000098167  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0043  tRNA-Arg  89.83 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000076274  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0045  tRNA-Arg  89.83 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000811404  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0047  tRNA-Arg  89.83 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000959117  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0049  tRNA-Arg  89.83 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000951803  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0044  tRNA-Arg  89.83 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000145436  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0046  tRNA-Arg  89.83 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000251633  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0048  tRNA-Arg  89.83 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000258429  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0050  tRNA-Arg  89.83 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000285185  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0042  tRNA-Arg  89.83 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000133594  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0044  tRNA-Arg  89.83 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000151065  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1999  tRNA-Arg  86.49 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0056  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000025331  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0037  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0424751  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna108  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000789461  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0055  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000268811  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna109  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000319749  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0040  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0409626  hitchhiker  0.00769115 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0110  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.607577  hitchhiker  0.0000634029 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t09  tRNA-Arg  89.47 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.146869  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0042  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.046483  hitchhiker  0.00783232 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0050  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000319175  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0008  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000700916  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03504  tRNA-Arg  89.47 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna111  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00293303  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0041  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0453151  hitchhiker  0.00788518 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0035  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.042903  hitchhiker  0.00756104 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0038  tRNA-Lys  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0049  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000247527  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0043  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0814997  hitchhiker  0.00811057 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0047  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000053333  hitchhiker  0.0000810038 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0039  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0446173  hitchhiker  0.00751458 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0020  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000211793  normal  0.0116052 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0034  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620516  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0036  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.042903  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0713  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0113  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.196307  hitchhiker  0.0000602904 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03502  tRNA-Arg  89.47 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03500  tRNA-Arg  89.47 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0114  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195511  hitchhiker  0.0000613432 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03506  tRNA-Arg  89.47 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0049  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000321594  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0057  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0017  tRNA-Arg  97.3 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0421283  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0034  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0228337  hitchhiker  0.00733773 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna112  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00685075  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0023  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00552371  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0022  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00548684  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0017  tRNA-Arg  91.23 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0051  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000808669  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0102  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000000831784  decreased coverage  0.000000220654 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0052  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000305181  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna106  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000169695  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0053  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000298412  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0143  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000714151  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1532  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0107  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000608145 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0108  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000608145 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0115  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.125071  hitchhiker  0.0000608145 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna110  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00293303  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0109  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00006448 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03503  tRNA-Arg  89.47 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03501  tRNA-Arg  89.47 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03499  tRNA-Arg  89.47 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0112  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456139  hitchhiker  0.0000639392 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>