More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_R0016 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_R0010  tRNA-Ala  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.870532  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0036  tRNA-Ala  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.121176  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0016  tRNA-Ala  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.367308  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0052  tRNA-Ala  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.495975  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tAla02  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.970472 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0027  tRNA-Ala  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.554328 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0047  tRNA-Ala  92 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.591987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0013  tRNA-Ala  92 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0447386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0069  tRNA-Ala  92 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.181592  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0059  tRNA-Ala  92 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.455983  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0017  tRNA-Ala  92 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0053  tRNA-Ala  92 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0003  tRNA-Ala  92 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0047  tRNA-Ala  92 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0053  tRNA-Ala  92 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0045  tRNA-Ala  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000176076  normal  0.226339 
 
 
-
 
NC_002950  PGt05  tRNA-Ala  90.67 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000322453 
 
 
-
 
NC_002950  PGt30  tRNA-Ala  90.67 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt36  tRNA-Ala  90.67 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.244061 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0045  tRNA-Ala  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt45  tRNA-Ala  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t13664  tRNA-Ala  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.235996  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07699  tRNA-Ala  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.515536  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0059  tRNA-Ala  91.18 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0006  tRNA-Ala  91.18 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Val-3  tRNA-Val  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00184226  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0046  tRNA-Val  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.461452  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1248  tRNA-Val  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.134542  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0079  tRNA-Ala  87.84 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.231908  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0083  tRNA-Ala  94 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0048  tRNA-Ala  87.84 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00554369  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0024  tRNA-Ala  87.84 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00249338  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0076  tRNA-Ala  94 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.989277 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0030  tRNA-Ala  94 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.284622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0654  tRNA-Ala  87.84 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1372  tRNA-Ala  87.84 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0023  tRNA-Ala  94 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0007  tRNA-Ala  94 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291536 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0050  tRNA-Ala  91.23 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00215399  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0037  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.021593 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0742  tRNA-Ala  92.45 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0018  tRNA-Ala  91.23 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000012168  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0041  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0260276 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0009  tRNA-Ala  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2507  tRNA-Ala  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2773  tRNA-Ala  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0009  tRNA-Ala  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0078  tRNA-Ala  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2213  tRNA-Ala  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2460  tRNA-Ala  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0023  tRNA-Ala  92.45 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00683735  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0034  tRNA-Ala  92.45 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0822071  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0052  tRNA-Ala  92.45 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00134949  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0062  tRNA-Ala  92.45 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.128618  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0030  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0020  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.18478  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt02  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt11  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt02  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt11  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0020  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0071  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0014  tRNA-Ala  91.07 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0213488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0035  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304574  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0072  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.821542  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0061  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0056  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0046  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R19  tRNA-Ala  86.76 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0017  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0394632  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt023  tRNA-Ala  95.35 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00025586  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0004  tRNA-Ala  89.83 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108101  normal  0.807397 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0020  tRNA-Ala  89.83 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.71083e-16  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0029  tRNA-Ala  89.83 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000220959  unclonable  0.000000053075 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0041  tRNA-Ala  89.83 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000493148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0019  tRNA-Ala  89.83 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0023  tRNA-Ala  89.83 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0032  tRNA-Ala  89.83 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0020  tRNA-Ala  89.83 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0164  tRNA-Ala  89.83 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.405268  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1707  tRNA-Ala  89.83 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1834  tRNA-Ala  89.83 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0028  tRNA-Ala  92.68 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0037  tRNA-Ala  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0234109  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0004  tRNA-Ala  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0016  tRNA-Ala  92.68 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0058  tRNA-Ala  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAArgVIMSS1309129  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.751283  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0068  tRNA-Ala  92.68 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0431  tRNA-Ala  86.89 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.147993  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0063  tRNA-Ala  90.38 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.808449  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0020  tRNA-Ala  90.38 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0048  tRNA-Ala  90.38 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.544704  hitchhiker  0.00053111 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0072  tRNA-Ala  90.38 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000540506  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0037  tRNA-Ala  90.38 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00177627  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0021  tRNA-Ala  89.29 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.584667  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0083  tRNA-Ala  90.38 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000917058  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0021  tRNA-Ala  90.38 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.984556  normal  0.270863 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0050  tRNA-Ala  90.38 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0200036 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0058  tRNA-Ala  90.38 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>