108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_R0005 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_R0005  tRNA-OTHER  100 
 
 		 98 bp  194  3e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0033  tRNA-OTHER  95.92 
 
 		 98 bp  163  1e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0001  tRNA-OTHER  91.67 
 
 		 98 bp  127  5e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0811775 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0024  tRNA-OTHER  92.08 
 
 		 101 bp  123  8e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0028  tRNA-OTHER  89.47 
 
 		 95 bp  109  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000246213 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0026  tRNA-Lys  90.1 
 
 		 101 bp  107  5e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.371557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0026  tRNA-OTHER  89.11 
 
 		 101 bp  99.6  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0024  tRNA-OTHER  88.78 
 
 		 98 bp  93.7  7e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0359457 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0003  tRNA-Arg  97.87 
 
 		 78 bp  85.7  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.79204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0013  tRNA-OTHER  87.13 
 
 		 101 bp  83.8  0.000000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0012  tRNA-Arg  95.74 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0025  tRNA-Arg  97.44 
 
 		 78 bp  69.9  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.954082 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0001  tRNA-Arg  93.62 
 
 		 79 bp  69.9  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.651067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0027  tRNA-Lys  97.3 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.968088 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0034  tRNA-Lys  97.3 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0036  tRNA-Arg  97.3 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.633015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_6  tRNA-Arg  100 
 
 		 94 bp  61.9  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_7  tRNA-Arg  100 
 
 		 94 bp  61.9  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.010437 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0034  tRNA-Arg  94.87 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0036  tRNA-OTHER  97.14 
 
 		 99 bp  61.9  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0011  tRNA-OTHER  97.37 
 
 		 119 bp  60  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0021  tRNA-Lys  97.06 
 
 		 75 bp  60  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.360576 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0031  tRNA-Arg  97.06 
 
 		 77 bp  60  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000138998  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0028  tRNA-Arg  96.97 
 
 		 77 bp  58  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221183 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0040  tRNA-Arg  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0016  tRNA-Arg  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.625219  normal  0.104037 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0844  tRNA-Arg  94.12 
 
 		 79 bp  52  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.998646  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0015  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000519668  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0123  tRNA-Arg  93.94 
 
 		 78 bp  50.1  0.0001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.553606  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tArg04  tRNA-Arg  93.94 
 
 		 80 bp  50.1  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0364203  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0015  tRNA-Arg  90.24 
 
 		 77 bp  50.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000291538  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1875  putative ATP binding protein  96.55 
 
 		 777 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0023  tRNA-OTHER  93.94 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0046836 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0045  tRNA-OTHER  96.55 
 
 		 109 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAArgVIMSS1309070  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0008  tRNA-Lys  91.89 
 
 		 78 bp  50.1  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0194876  normal  0.882608 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0017  tRNA-OTHER  96.55 
 
 		 108 bp  50.1  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0043  tRNA-Asp  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383968  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0027  tRNA-Arg  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000775321  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0034  tRNA-Asp  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0915271  hitchhiker  0.000000414345 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0032  tRNA-Arg  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.151331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0027  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 104 bp  50.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0001  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 78 bp  48.1  0.0004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0062  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0906817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0024  tRNA-OTHER  88.64 
 
 		 97 bp  48.1  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1558  hypothetical protein  100 
 
 		 267 bp  48.1  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_4  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 94 bp  48.1  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0532674 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0084  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200461  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0037  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.462586  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0029  tRNA-Met  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0017  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01580  tRNA-Cys  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01590  tRNA-Cys  100 
 
 		 91 bp  46.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0008  tRNA-Pro  100 
 
 		 79 bp  46.1  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0046  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_10  tRNA-Lys  96.77 
 
 		 93 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_3  tRNA-Arg  93.55 
 
 		 94 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0015  tRNA-Ser  100 
 
 		 67 bp  46.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0082796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0040  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471615  normal  0.863144 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0036  tRNA-Ala  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0044  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.69312  normal  0.302799 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0056  tRNA-Arg  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000671008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0049  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.465736  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS05228  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0046  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712276  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0019  tRNA-Arg  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0014  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.206321  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2520  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00150959  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2523  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000187168  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2531  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000000138552  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2622  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.130874  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2224  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000681563  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2227  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000134564  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2235  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000178277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2308  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00164711  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0052  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000819113  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0013  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0017  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0054  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0013  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0047  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.792355  normal  0.693567 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0027  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14035  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00157329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0028  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.402062  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0034  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0011  tRNA-Asp  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.619648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0016  tRNA-Asp  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0022  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000272434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0026  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.863353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0048  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0001  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0487853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0084  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 78 bp  44.1  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0048  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0030  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220532  normal  0.0165224 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0066  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.659746  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09040  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.431816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0036  tRNA-Asp  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0037  tRNA-Asp  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.060369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>