37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_R0047 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_R0047  tRNA-Lys  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.271132  normal  0.595667 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0048  tRNA-Lys  90.54 
 
 
74 bp  91.7  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.048263  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0006  tRNA-Lys  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0006  tRNA-Lys  87.84 
 
 
73 bp  67.9  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.657392  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0040  tRNA-Lys  88.71 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00746142 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0024  tRNA-Lys  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0003  tRNA-Lys  88.68 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.237532  decreased coverage  0.00216648 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0021  tRNA-Lys  100 
 
 
74 bp  54  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00204065  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0003  tRNA-Arg  85.33 
 
 
78 bp  54  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.79204  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0001  tRNA-Arg  90.7 
 
 
79 bp  54  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.651067  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0053  tRNA-Lys  85.48 
 
 
74 bp  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.231894  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0031  tRNA-Lys  85.48 
 
 
74 bp  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0007  tRNA-Lys  85.14 
 
 
73 bp  52  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40291  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0034  tRNA-Lys  83.78 
 
 
74 bp  52  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.336319  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0014  tRNA-Lys  83.78 
 
 
74 bp  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247268  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0011  tRNA-Lys  83.78 
 
 
74 bp  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.312587  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0035  tRNA-Lys  83.78 
 
 
74 bp  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0042  tRNA-Lys  83.78 
 
 
74 bp  52  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0039  tRNA-Lys  83.78 
 
 
74 bp  52  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0038  tRNA-Lys  83.78 
 
 
74 bp  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.944323  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0034  tRNA-Lys  83.78 
 
 
77 bp  52  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0031  tRNA-Lys  83.78 
 
 
74 bp  52  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0026  tRNA-Lys  83.78 
 
 
74 bp  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0144424  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0023  tRNA-Lys  83.78 
 
 
74 bp  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0236487  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0008  tRNA-Lys  86.15 
 
 
78 bp  50.1  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0194876  normal  0.882608 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0034  tRNA-Arg  86.15 
 
 
78 bp  50.1  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0049  tRNA-Lys  85.71 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.276362 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0058  tRNA-Lys  96.3 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0073  tRNA-Lys  82.43 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0042  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0024  tRNA-OTHER  91.18 
 
 
98 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0359457 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0033  tRNA-OTHER  89.47 
 
 
98 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_3  tRNA-Arg  86.21 
 
 
94 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0055  tRNA-Lys  82.43 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0017  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.476615  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0084  tRNA-Lys  86.21 
 
 
78 bp  44.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0001  tRNA-Lys  86.21 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0487853  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>