31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_R0001 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_R0001  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0030  tRNA-Arg  92.11 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0045  tRNA-Arg  94.92 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.249789 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0003  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.79204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0021  tRNA-Arg  95 
 
 		 104 bp  63.9  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.212228 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0041  tRNA-Arg  93.02 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0001  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000193558  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0027  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 104 bp  54  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0024  tRNA-His  96.67 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000441767  unclonable  9.7747e-19 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0058  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0059  tRNA-Arg  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0033  tRNA-OTHER  90.48 
 
 		 98 bp  52  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0031  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0048271  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0038  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.650606  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0006  tRNA-Ala  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0038  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.495611  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0087  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000016212  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0023  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0598975  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0034  tRNA-Arg  82.67 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0028  tRNA-Lys  84.29 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.903037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0025  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000185989  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0034  tRNA-Lys  82.67 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0012  tRNA-Arg  82.67 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0006  tRNA-Lys  86.44 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0015  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0005  tRNA-OTHER  88.1 
 
 		 98 bp  44.1  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0030  tRNA-Val  100 
 
 		 100 bp  44.1  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.298715 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0011  tRNA-Arg  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_7  tRNA-Arg  85.19 
 
 		 94 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.010437 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_3  tRNA-Arg  85.19 
 
 		 94 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0164  tRNA-Pro  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>