81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_R0001 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_R0001  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000193558  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0036  tRNA-Arg  96.23 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.269516  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0011  tRNA-Arg  94.74 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0024  tRNA-Arg  96.08 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000167821  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0024  tRNA-Arg  96.08 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000092316  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0037  tRNA-Arg  92.98 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000022611  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0057  tRNA-Arg  91.38 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00400024  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0004  tRNA-Arg  91.38 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0050  tRNA-Arg  89.83 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000000388549  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0065  tRNA-Arg  92.16 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.68192e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0044  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0048  tRNA-Arg  90.2 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0098  tRNA-Arg  93.02 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237653  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2040  tRNA-Arg  90.2 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000158642  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1761  tRNA-Arg  90.2 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1468  tRNA-Arg  90.2 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  90.2 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.581803  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0038  tRNA-Arg  90.2 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.495611  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0624  tRNA-Arg  93.02 
 
 
79 bp  61.9  0.00000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00406719  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0955  tRNA-Arg  87.93 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0134122  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0053  tRNA-Arg  87.93 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376557  hitchhiker  8.69297e-22 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0009  tRNA-Arg  88.89 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00246508  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0041  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.225323  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0017  tRNA-Arg  86.15 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0045  tRNA-Arg  89.8 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.249789 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0001  tRNA-Arg  90.91 
 
 
75 bp  56  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0037  tRNA-Arg  90.91 
 
 
77 bp  56  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  90.91 
 
 
74 bp  56  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000427256  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2137  tRNA-Arg  88.24 
 
 
77 bp  54  0.000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00960478  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0004  tRNA-Arg  90.7 
 
 
74 bp  54  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.468205  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2212  tRNA-Arg  88.24 
 
 
77 bp  54  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.249062  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0034  tRNA-Arg  90.7 
 
 
74 bp  54  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.904479  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0023  tRNA-Arg  88.24 
 
 
74 bp  54  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0048  tRNA-Arg  90.7 
 
 
77 bp  54  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00527947  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0014  tRNA-Arg  90.7 
 
 
74 bp  54  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0054104  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1683  tRNA-Arg  88.24 
 
 
77 bp  54  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.792102  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0003  tRNA-Arg  87.93 
 
 
76 bp  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0010  tRNA-Arg  90.48 
 
 
74 bp  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.552541  hitchhiker  0.000550393 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_R0070  tRNA-Arg  87.04 
 
 
78 bp  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.143256  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0060  tRNA-Arg  86.21 
 
 
77 bp  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0038  tRNA-Arg  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111435  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0054  tRNA-Arg  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.403688  hitchhiker  0.000271304 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0041  tRNA-Arg  85.96 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0035  tRNA-Arg  91.89 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0049  tRNA-Arg  91.89 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0007  tRNA-Arg  90.24 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.35256e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0065  tRNA-Arg  90.24 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0057  tRNA-Arg  90 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0970774  normal  0.768528 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0059  tRNA-Arg  90 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0012  tRNA-Arg  88.64 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0108996  unclonable  0.0000000137138 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1611  tRNA-Arg  85.71 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.707848 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0059  tRNA-Arg  90 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0042  tRNA-Arg  90 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1576  tRNA-Arg  85.71 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0058  tRNA-Arg  90 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0041  tRNA-Arg  90 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00815383  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0035  tRNA-Arg  90 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.16654  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2513  tRNA-Arg  91.43 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0504098  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  91.43 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0099  tRNA-Arg  86.27 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.108565  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0030  tRNA-Arg  89.36 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0075  tRNA-Arg  88.37 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0336588  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0074  tRNA-Arg  88.37 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.214945  normal  0.0186415 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  91.43 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000884624  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0073  tRNA-Arg  88.37 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0334758  normal  0.0113407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0072  tRNA-Arg  88.37 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0596228 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0003  tRNA-Arg  87.23 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0022  tRNA-Arg  91.43 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000027529  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0009  tRNA-Arg  86.27 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0031  tRNA-Arg  86.27 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.745897  normal  0.775503 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0037  tRNA-Arg  88.1 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0084  tRNA-Arg  84.48 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200461  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0003  tRNA-Arg  86 
 
 
78 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.79204  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0048  tRNA-Arg  88.1 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.544929  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0009  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.29751  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0026  tRNA-Arg  86 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0019  tRNA-Arg  84.48 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000464578  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0051  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0065  tRNA-Arg  93.33 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0025488  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0034  tRNA-Arg  86.96 
 
 
78 bp  44.1  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0019  tRNA-Arg  84.48 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>