14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_R0030 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_R0030  tRNA-Val  100 
 
 
100 bp  198  2.0000000000000003e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.298715 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0025  tRNA-Ala  93.75 
 
 
76 bp  48.1  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000185989  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0049  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000106187  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0035  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0049  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00365867  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0164  tRNA-Pro  100 
 
 
79 bp  46.1  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0033  tRNA-OTHER  100 
 
 
98 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0087  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  46.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000016212  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0003  tRNA-Arg  100 
 
 
78 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.79204  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0036  tRNA-Ala  96.3 
 
 
75 bp  46.1  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0006  tRNA-Ala  100 
 
 
75 bp  46.1  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0038  tRNA-His  100 
 
 
76 bp  44.1  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.650606  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0024  tRNA-His  100 
 
 
76 bp  44.1  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000441767  unclonable  9.7747e-19 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0001  tRNA-Arg  100 
 
 
75 bp  44.1  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>