32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_R0006 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_R0006  tRNA-Lys  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0031  tRNA-Lys  95.16 
 
 
74 bp  99.6  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0053  tRNA-Lys  95.16 
 
 
74 bp  99.6  9e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.231894  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0034  tRNA-Lys  90.54 
 
 
74 bp  91.7  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.336319  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0047  tRNA-Lys  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.271132  normal  0.595667 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0007  tRNA-Lys  89.19 
 
 
73 bp  75.8  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40291  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0021  tRNA-Lys  88.71 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00204065  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0073  tRNA-Lys  86.49 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0027  tRNA-Lys  88.14 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0048  tRNA-Lys  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.048263  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0055  tRNA-Lys  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0058  tRNA-Lys  87.1 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0049  tRNA-Lys  85.29 
 
 
74 bp  56  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.276362 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0028  tRNA-Lys  87.93 
 
 
76 bp  52  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.903037  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0006  tRNA-Lys  85.71 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.657392  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0003  tRNA-Lys  83.82 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.237532  decreased coverage  0.00216648 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0017  tRNA-OTHER  100 
 
 
108 bp  48.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0035  tRNA-Lys  83.82 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1875  putative ATP binding protein  100 
 
 
777 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0045  tRNA-OTHER  100 
 
 
109 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0055  tRNA-Thr  93.55 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00352038  hitchhiker  0.00739911 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0001  tRNA-Arg  86.44 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0011  tRNA-Thr  88.24 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0008  tRNA-Thr  88 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.443897  hitchhiker  0.0012739 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0024  tRNA-Lys  82.43 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0040  tRNA-Lys  83.87 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00746142 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0075  tRNA-Arg  86.96 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306891  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0053  tRNA-Arg  86.96 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000144377  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0038  tRNA-Arg  86.96 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000962108  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0011  tRNA-Thr  85.25 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000623818  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0038  tRNA-Cys  100 
 
 
96 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0006  tRNA-Lys  84.48 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.507736 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>