18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_R0027 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_R0027  tRNA-Arg  100 
 
 
104 bp  206  8e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0021  tRNA-Arg  84.62 
 
 
104 bp  79.8  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.212228 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0030  tRNA-Arg  97.44 
 
 
76 bp  69.9  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0001  tRNA-Arg  92.31 
 
 
75 bp  54  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0005  tRNA-OTHER  96.55 
 
 
98 bp  50.1  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0045  tRNA-Arg  91.67 
 
 
75 bp  48.1  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.249789 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0046  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  46.1  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0044  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  46.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.69312  normal  0.302799 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0043  tRNA-Asp  100 
 
 
76 bp  46.1  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383968  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0040  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  46.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471615  normal  0.863144 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0015  tRNA-Ser  100 
 
 
67 bp  46.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0082796  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0009  tRNA-Lys  100 
 
 
73 bp  44.1  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000488659  normal  0.0708326 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0036  tRNA-Ala  100 
 
 
75 bp  44.1  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0045  tRNA-His  100 
 
 
73 bp  44.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.169896 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6023  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  44.1  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0051  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  44.1  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.510078  normal  0.0905672 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0054  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  44.1  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0008  tRNA-Pro  100 
 
 
79 bp  44.1  0.007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>