28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_R0015 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_R0015  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0033  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0015  tRNA-Leu  88.71 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0025  tRNA-Leu  87.88 
 
 		 88 bp  67.9  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0002  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0021  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.273814  normal  0.0446138 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0001  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0002  tRNA-Leu  86.3 
 
 		 88 bp  65.9  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0003  tRNA-Leu  86.3 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0005  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.196459  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0021  tRNA-Leu  86.76 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.283628  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  NMAR_2  tRNA-OTHER  100 
 
 		 124 bp  61.9  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.114787 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0012  tRNA-Leu  87.1 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0020  tRNA-OTHER  100 
 
 		 104 bp  60  0.00000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0002  tRNA-Leu  87.1 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0038  tRNA-Leu  87.1 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.272303  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0006  tRNA-Leu  88.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0008  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 88 bp  54  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00540287 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0006  tRNA-Ala  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0040  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471615  normal  0.863144 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0015  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 67 bp  44.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0082796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0046  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0038  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.650606  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0044  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.69312  normal  0.302799 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0052  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.294271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0001  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0024  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000441767  unclonable  9.7747e-19 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>