16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCAL_5 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  PCAL_5  tRNA-Asn  100 
 
 		 111 bp  220  6e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0037  tRNA-Asn  100 
 
 		 78 bp  93.7  9e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_4  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 94 bp  69.9  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0532674 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_9  tRNA-Cys  90.91 
 
 		 111 bp  69.9  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0034  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 78 bp  69.9  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0008  tRNA-Lys  93.02 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0194876  normal  0.882608 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0021  tRNA-Lys  93.02 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.360576 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0035  tRNA-Asn  93.62 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0023  tRNA-OTHER  96.88 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0046836 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_10  tRNA-Lys  93.02 
 
 		 93 bp  54  0.000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0027  tRNA-Lys  93.02 
 
 		 77 bp  54  0.000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.968088 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_11  tRNA-Trp  85.14 
 
 		 112 bp  52  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000281475 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0026  tRNA-OTHER  96.43 
 
 		 101 bp  48.1  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0026  tRNA-Lys  96.43 
 
 		 101 bp  48.1  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.371557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0012  tRNA-Lys  90.7 
 
 		 77 bp  46.1  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.711012  normal  0.109612 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0010  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 97 bp  44.1  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>