9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCAL_11 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  PCAL_11  tRNA-Trp  100 
 
 		 112 bp  222  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000281475 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0012  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.146642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_9  tRNA-Cys  92.73 
 
 		 111 bp  77.8  0.0000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0032  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.262491 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0035  tRNA-Trp  100 
 
 		 94 bp  77.8  0.0000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.138345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_5  tRNA-Asn  85.14 
 
 		 111 bp  52  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0010  tRNA-Lys  96.3 
 
 		 97 bp  46.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0007  tRNA-Trp  93.55 
 
 		 112 bp  46.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.31683  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0019  tRNA-Cys  89.74 
 
 		 77 bp  46.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0308223  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>