11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_R0007 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_R0007  tRNA-Trp  100 
 
 		 112 bp  222  9.999999999999999e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.31683  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0020  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 98 bp  58  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.06804  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0010  tRNA-Lys  96.77 
 
 		 97 bp  54  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0005  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 104 bp  48.1  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.892515  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0011  tRNA-OTHER  93.55 
 
 		 119 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_11  tRNA-Trp  93.55 
 
 		 112 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000281475 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0027  tRNA-Lys  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.968088 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0032  tRNA-Trp  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.262491 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0012  tRNA-Lys  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.711012  normal  0.109612 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0036  tRNA-OTHER  93.55 
 
 		 99 bp  46.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_10  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 93 bp  44.1  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>