17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_R0035 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_R0035  tRNA-Trp  100 
 
 		 94 bp  186  6e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.138345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0012  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  93.7  7e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.146642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0032  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.262491 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_11  tRNA-Trp  100 
 
 		 112 bp  77.8  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000281475 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0010  tRNA-Lys  96.67 
 
 		 97 bp  52  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0025  tRNA-Trp  100 
 
 		 175 bp  52  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000000493252  hitchhiker  0.00000464585 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0019  tRNA-Cys  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0308223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0013  tRNA-Trp  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_10  tRNA-Lys  93.55 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0027  tRNA-Lys  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.968088 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0036  tRNA-OTHER  93.55 
 
 		 99 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0036  tRNA-Trp  96.15 
 
 		 175 bp  44.1  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0046  tRNA-Trp  96.15 
 
 		 181 bp  44.1  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0029  tRNA-Ile  91.18 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0012  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.711012  normal  0.109612 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0038  tRNA-Cys  96.15 
 
 		 96 bp  44.1  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0042  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>