44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_R0042 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_R0042  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0033  tRNA-Ala  92.86 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.397319  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0023  tRNA-Ala  92.86 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0028  tRNA-Ala  92.86 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0021  tRNA-Ala  92.86 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0026  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.789038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0067  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0071  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0022  tRNA-Ala  90.38 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0002  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0040  tRNA-Ala  90.38 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0056  tRNA-Ala  90.38 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0038  tRNA-Ala  89.29 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0044  tRNA-Thr  87.1 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0020  tRNA-Thr  87.1 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.420795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0033  tRNA-Thr  87.1 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.357383 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0002  tRNA-Ala  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.157867  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0016  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00130891  unclonable  0.0000000248752 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0002  tRNA-Ala  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0061  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.060287  hitchhiker  0.000000000381707 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0012  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.147828 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0033  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0049  tRNA-Ala  92.68 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.210178  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0022  tRNA-Ala  92.68 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0052  tRNA-Ala  89.8 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0008  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00250215  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0017  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.476615  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0038  tRNA-Thr  100 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0047  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0027  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000535173  decreased coverage  0.000361063 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0016  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000587124  normal  0.11774 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0024  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000131276  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0045  tRNA-Asp  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0022  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.213128  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0002  tRNA-Ala  91.18 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0003  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.220324  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0010  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0605022 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0089  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  6.62711e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0035  tRNA-Trp  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.138345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0007  tRNA-Ala  83.78 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0649693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0002  tRNA-Ala  91.18 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.22367  normal  0.0175054 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0003  tRNA-Ala  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0411773  normal  0.562233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0002  tRNA-Ala  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534142 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0002  tRNA-Ala  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.353187  normal  0.0609648 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>