159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_R0028 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_R0021  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0033  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.397319  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0023  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0028  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0038  tRNA-Ala  97.26 
 
 		 73 bp  129  9.000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0042  tRNA-Ala  92.86 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0052  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0047  tRNA-Ala  93.48 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0022  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.213128  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0016  tRNA-Ala  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00130891  unclonable  0.0000000248752 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0009  tRNA-Ala  88.14 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0006  tRNA-Ala  88.14 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0002  tRNA-Ala  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.157867  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0002  tRNA-Ala  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0022  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0040  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0056  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0017  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.476615  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0045  tRNA-Asp  91.11 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3218  tRNA-Val  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.229381  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3219  tRNA-Val  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232653  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3220  tRNA-Val  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0584974  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3221  tRNA-Val  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0555277  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3222  tRNA-Val  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.055188  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3223  tRNA-Val  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0588431  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00140  tRNA-Ala  92.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.110426 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0077  tRNA-Val  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.035914  normal  0.156814 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0078  tRNA-Val  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0323517  normal  0.156199 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0079  tRNA-Val  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.101536  normal  0.15355 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0080  tRNA-Val  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273364  normal  0.0951081 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0081  tRNA-Val  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.277615  normal  0.0524601 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0082  tRNA-Val  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.278662  normal  0.0519347 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0083  tRNA-Val  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.380534  normal  0.052943 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0014  tRNA-Val  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.20827  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0045  tRNA-Val  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000428882  hitchhiker  0.00000000692947 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0047  tRNA-Val  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0721509  normal  0.0848173 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0049  tRNA-Val  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0385641  normal  0.0854931 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0051  tRNA-Val  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114614  normal  0.0557031 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0053  tRNA-Val  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.113148  normal  0.0557031 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0055  tRNA-Val  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.100813  normal  0.0566569 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0024  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188635  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0047  tRNA-Ala  96.77 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_R0059  tRNA-Ala  87.3 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0003  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000742572  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0002  tRNA-Ala  87.3 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.227888  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0008  tRNA-Ala  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00250215  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0025  tRNA-Ala  87.3 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.326972  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0010  tRNA-Ala  96.77 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000307763  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0051  tRNA-Ala  96.77 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0016  tRNA-Val  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0267125  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0002  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0026  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.789038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0067  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0071  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0040  tRNA-Ala  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000841644  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0016  tRNA-Ala  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.168843  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0003  tRNA-Ala  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0022  tRNA-Ala  85.96 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0049  tRNA-Ala  85.96 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.210178  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R10  tRNA-Val  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0020  tRNA-Ala  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0032  tRNA-Val  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0382858 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0022  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0049  tRNA-Pro  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0003  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0015  tRNA-His  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.956741  normal  0.235739 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0028  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.148209  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0057  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0035  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000342792  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0017  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1639  tRNA-Val  85.71 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  2.42917e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0056  tRNA-Ala  90 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0054  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0506  tRNA-Val  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000210489  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14040  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0988532 
 
 
-
 
NC_003295  RS02886  tRNA-Val  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.96324  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Val-3  tRNA-Val  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.752155  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2476  tRNA-Val  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0042  tRNA-Val  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.408267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0050  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.903687  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0055  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.186103  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0006  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0020  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0044  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.167304  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0062  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2123  tRNA-Val  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0029  tRNA-Val  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000448285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0032  tRNA-Val  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  9.69442e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0054  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0023  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.365423 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0057  tRNA-Val  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00234927  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0058  tRNA-Val  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00230233  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0059  tRNA-Val  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00221278  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0027  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.987879  normal  0.104292 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0002  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0022  tRNA-Val  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.692684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0044  tRNA-Val  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2318  tRNA-Val  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0283125  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2359  tRNA-Val  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1228  tRNA-Val  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>