18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_R0040 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_R0022  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0040  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0056  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0071  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0042  tRNA-Ala  90.38 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0023  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0016  tRNA-Ala  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00130891  unclonable  0.0000000248752 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0021  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0028  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0033  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.397319  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0049  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.210178  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0022  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0052  tRNA-Ala  85.96 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0002  tRNA-Ala  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0002  tRNA-Ala  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.157867  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0016  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0033  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0062  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>