18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_AR0071 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_AR0071  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0022  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0040  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0056  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0022  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0049  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.210178  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0022  tRNA-Ala  91.3 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.213128  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0028  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0101867  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0038  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0016  tRNA-Ala  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00130891  unclonable  0.0000000248752 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0004  tRNA-Ala  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.554141  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_R0059  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0002  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00133313  normal  0.0937878 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0030  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00218257  normal  0.047743 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0022  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0003  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000742572  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0024  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188635  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0036  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>