17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_R0059 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_R0059  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0002  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00133313  normal  0.0937878 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0030  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00218257  normal  0.047743 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0022  tRNA-Ala  97.22 
 
 		 72 bp  127  4.0000000000000003e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_R0059  tRNA-Ala  93.06 
 
 		 72 bp  103  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0025  tRNA-Ala  93.06 
 
 		 72 bp  103  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.326972  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0002  tRNA-Ala  93.06 
 
 		 72 bp  103  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.227888  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0062  tRNA-Ala  93.06 
 
 		 72 bp  103  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0033  tRNA-Ala  93.06 
 
 		 72 bp  103  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0016  tRNA-Ala  93.06 
 
 		 72 bp  103  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0016  tRNA-Ala  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0044  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0031  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0071  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_265  tRNA-Ala  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0005  tRNA-Ala  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.177438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>