14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_R0049 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_R0022  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0049  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.210178  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0071  tRNA-Ala  87.67 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0022  tRNA-Ala  84.93 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0040  tRNA-Ala  84.93 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0056  tRNA-Ala  84.93 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0042  tRNA-Ala  92.68 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0033  tRNA-Ala  85.96 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.397319  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0023  tRNA-Ala  85.96 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0028  tRNA-Ala  85.96 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0021  tRNA-Ala  85.96 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0002  tRNA-Ala  91.89 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0002  tRNA-Ala  91.89 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.157867  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0052  tRNA-Ala  88.1 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>