29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_R0036 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_R0036  tRNA-Ala  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0013  tRNA-Ala  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000441273  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0004  tRNA-Ala  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.155196  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0051  tRNA-Ala  96.88 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.510078  normal  0.0905672 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0016  tRNA-Ala  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00130891  unclonable  0.0000000248752 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0008  tRNA-Pro  100 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0044  tRNA-Ala  84.21 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.521013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0025  tRNA-Ala  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000185989  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0054  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0030  tRNA-Val  96.3 
 
 		 100 bp  46.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.298715 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0005  tRNA-OTHER  100 
 
 		 98 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1371  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.579151 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0043  tRNA-Asp  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383968  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0046  tRNA-Ala  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0028  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000264916  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.893816  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0027  tRNA-Arg  100 
 
 		 104 bp  44.1  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0032  tRNA-Met  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0071  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1816  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0046  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0017  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0022  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0044  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.69312  normal  0.302799 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0018  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.338609  normal  0.373467 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0055  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.138155  hitchhiker  0.00896758 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0002  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.385644 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0040  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471615  normal  0.863144 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0015  tRNA-Ser  100 
 
 		 67 bp  44.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0082796  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>