55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_R0046 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_R0046  tRNA-Ala  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0046  tRNA-Ala  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.150337  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0048  tRNA-Ala  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000143033  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0013  tRNA-Ala  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000441273  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0017  tRNA-Ala  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156836  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0027    100 
 
 		 378 bp  56  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0060    100 
 
 		 377 bp  56  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709504 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0026  tRNA-Val  88 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000411365 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0028  tRNA-Val  88 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000436096 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0029  tRNA-Val  88 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.575368 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0027  tRNA-Val  88 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.60657 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0037    100 
 
 		 384 bp  52  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0118004 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0032    100 
 
 		 376 bp  52  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.550963 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0042    100 
 
 		 376 bp  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133373  normal  0.395304 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2840    96.55 
 
 		 363 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2891    96.55 
 
 		 363 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.171814 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2910    96.55 
 
 		 363 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.93402 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2909    96.55 
 
 		 363 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0323379 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4975    96.55 
 
 		 363 bp  50.1  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0450462  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0034  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000000469918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3023    96.55 
 
 		 363 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0263643 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3862    96.55 
 
 		 363 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.896825  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07727  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4764    96.55 
 
 		 363 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000108878  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0033  tRNA-Ala  91.11 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5057  10Sa RNA (tmRNA)  96.55 
 
 		 363 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.434725  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0015  tRNA-Ala  91.89 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.233572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0081  tRNA-Ala  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.659865  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0026    96.43 
 
 		 362 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0065    96.43 
 
 		 363 bp  48.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0051  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0072    96.43 
 
 		 380 bp  48.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2839    96.43 
 
 		 362 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0020  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0022  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.836279  normal  0.0847494 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0030    96.43 
 
 		 362 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.462293  normal  0.749063 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0040  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0421069 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01123    96.43 
 
 		 367 bp  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0023    96.3 
 
 		 371 bp  46.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000931822  normal  0.479767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0016    96.3 
 
 		 384 bp  46.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000497382  normal  0.186928 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0036  tRNA-Ala  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07640    96.3 
 
 		 371 bp  46.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.755411  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15510  tRNA-Val  86 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00141573  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.34848  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0033    96.15 
 
 		 354 bp  44.1  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0569  sRNA  96.15 
 
 		 375 bp  44.1  0.004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0494255  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0050    96.15 
 
 		 362 bp  44.1  0.004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0037  tRNA-Val  86 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1719  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000778292  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0035  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.746107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0047  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1466  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0000000857792  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1673  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000000301806  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2191  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000534865  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2233  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000102912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>