209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_R0043 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_R0043  tRNA-Asp  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383968  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tAsp01  tRNA-Asp  95.45 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0846987  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0049  tRNA-Asp  88.16 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000144265  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0006  tRNA-Asp  93.75 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.217268  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0651  tRNA-Asp  97.44 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.672568  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0052  tRNA-Asp  90.74 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000156743  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0050  tRNA-Asp  90.74 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0003  tRNA-Asp  93.18 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0046  tRNA-Asp  94.87 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000106741  normal  0.144267 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t07  tRNA-Asp  94.87 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.802625  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0037  tRNA-Asp  91.49 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.060369  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0041  tRNA-Asp  94.87 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0134468  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0036  tRNA-Asp  91.49 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0051  tRNA-Asp  94.87 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.681144  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0047  tRNA-Asp  88.89 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.488675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0013  tRNA-Asp  94.74 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00001857  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asp-2  tRNA-Asp  91.11 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asp-3  tRNA-Asp  91.11 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0024  tRNA-Asp  94.59 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000583743  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0026  tRNA-Asp  94.59 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000484492  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0045  tRNA-Asp  91.11 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000116789  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  92.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0021  tRNA-Asp  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0002  tRNA-Asp  92.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0187578  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0035  tRNA-Asp  92.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000000429398  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0047  tRNA-Asp  92.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0050  tRNA-Asp  92.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0002  tRNA-Asp  92.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0035  tRNA-Asp  92.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000925215  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0047  tRNA-Asp  92.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0050  tRNA-Asp  92.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.989486  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0043  tRNA-Asp  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0019  tRNA-Asp  92.31 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.4765400000000006e-24  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0028  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0074  tRNA-Asp  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0004  tRNA-Asp  89.36 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.155888  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0057  tRNA-Asp  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0077  tRNA-Asp  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0148053  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0034  tRNA-Asp  94.29 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0178  tRNA-Asp  94.29 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0628271  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1829  tRNA-Asp  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.150198  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0072  tRNA-Asp  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.217203  normal  0.378802 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0046  tRNA-Asp  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0057  tRNA-Asp  90.7 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0112  tRNA-Asp  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00279074  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0038  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000426137 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0050  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0232692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0013  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.212749  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0025  tRNA-Ala  96.67 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000185989  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00004  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00065  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.528725  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0072  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.919613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0073  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt43  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.022546 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0008  tRNA-Pro  100 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0040  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0218  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.112301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0038  tRNA-Asp  90.24 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264026  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0042  tRNA-Asp  90.24 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000403419  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0230  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0179094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0036  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00224003  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0040  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00699414  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0277  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0290  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0426135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0279  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.703656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4106  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0303  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tAsp01  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 80 bp  50.1  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tAsp02  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 80 bp  50.1  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tAsp03  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 80 bp  50.1  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0005  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.196459  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4286  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.706333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0200  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4121  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4324  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.647358  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0024  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.43324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0025  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0290094  normal  0.12012 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0126  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0559205  normal  0.0859752 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0085  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.142476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0220  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0442087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0284  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.83496 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0017  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000152694  normal  0.0119772 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0046  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000445856  hitchhiker  0.00000000718315 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0048  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.042005  normal  0.0861498 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0050  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.041206  normal  0.0538679 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0052  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.11215  normal  0.0559478 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0054  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0628867  normal  0.0552316 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0295  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0406525  normal  0.534854 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0309  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00580589  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4227  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.297945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4129  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0268004  normal  0.303886 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0005  tRNA-OTHER  100 
 
 		 98 bp  50.1  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4643  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00729353  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4644  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00029583  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4708  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.806032  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5008  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0329155  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5009  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.730006  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5085  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.453014  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5197  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0882882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0228  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152009  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>