37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_R0013 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_R0013  tRNA-Ala  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000441273  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0017  tRNA-Ala  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156836  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0046  tRNA-Ala  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.150337  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0046  tRNA-Ala  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0036  tRNA-Ala  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0052  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0040  tRNA-Ala  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0421069 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13160  tRNA-Ala  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.10655  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0022  tRNA-Ala  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.409471 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0054  tRNA-Ala  86.79 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.243452  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32630  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.319038  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0044  tRNA-Ala  84.21 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.521013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0017  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0040  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000987892 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0039  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000377805  hitchhiker  0.000399875 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0020  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0051  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0043  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0042  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0324793  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11500  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.931498  hitchhiker  0.0025263 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0029  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184095  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0024  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0513079  normal  0.0822936 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6003  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.126047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0024  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.831109  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0008  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0978186  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35760  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.575984  normal  0.377782 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0016  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00136922  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0044  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0029  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1394  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0047  tRNA-Ala  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.337703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0047  tRNA-Ala  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000513142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0017  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000513914  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0050  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.573198  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0018  tRNA-Ala  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.245872  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0021  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.178891  normal  0.0364051 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0026  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.000000000000595128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>