127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_R0004 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_R0004  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.155196  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0017  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.476615  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0016  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00130891  unclonable  0.0000000248752 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07560  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.458436  normal  0.55227 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0003  tRNA-Ala  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.774544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0007  tRNA-Ala  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.110552  normal  0.490785 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.285591  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0050  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000486604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04940  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.669042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0051  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.510078  normal  0.0905672 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0049  tRNA-Pro  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0408586  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0046  tRNA-Pro  91.49 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0055  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.105758  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1816  tRNA-Ala  88.89 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14002  tRNA-Ala  88.89 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0036  tRNA-Ala  89.8 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0034  tRNA-Ala  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000924303  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0004  tRNA-Ala  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0025  tRNA-Ala  85.07 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000185989  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0002  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0002  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0002  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.30172 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0020  tRNA-Val  90.48 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0496105  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0064  tRNA-Ala  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0065  tRNA-Val  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0070  tRNA-Ala  86.79 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0001  tRNA-Ala  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.599986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0065  tRNA-Ala  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0040  tRNA-Val  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0054  tRNA-Ala  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127331  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.05432  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt08  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.711822  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt09  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.745225  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0001    100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0451223 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0026  tRNA-Val  88.46 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.289153  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0004  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.54255  normal  0.0153905 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0004  tRNA-OTHER  100 
 
 		 67 bp  48.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0005  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0004  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.679327 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0014  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.854137  normal  0.0928806 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0001  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0042  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0059  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.07343  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0043  tRNA-Val  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0172535  normal  0.864924 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0024  tRNA-Val  88.46 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0061  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.638683  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0007  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0959  tRNA-Gly  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0046  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4576  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0060  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312952  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0047  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0024  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113773  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0060  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18005  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0015  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409791  hitchhiker  0.00133566 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0052  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0063  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0058  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0037  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0055  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.9646 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0045  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.471231 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0060  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.766632 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0061  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0052  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.165358 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0005  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118248  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0024  tRNA-Val  88.46 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0054  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.290496  normal  0.747562 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0027  tRNA-Gly  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Val-2  tRNA-Val  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.516841  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t01  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t01  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0043  tRNA-Val  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.125725  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA1  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0045  tRNA-Val  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R7  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.365989  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0025  tRNA-Val  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057008  normal  0.409519 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0058  tRNA-Val  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03410  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000139149  hitchhiker  1.96604e-19 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0023  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 94 bp  46.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0167  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 94 bp  46.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1831  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 94 bp  46.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.399609  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0023  tRNA-Val  93.55 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.720893  normal  0.0127386 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0049  tRNA-Val  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0031  tRNA-Val  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0054  tRNA-Val  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.452754 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0001  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0839  tRNA-Gly  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.343418  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0033  tRNA-Pro  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0005  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.964403 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0031  tRNA-Val  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000478109 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0340  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1688  tRNA-Pro  87.23 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0559093  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0491  tRNA-Pro  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000930823  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0010  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0025  tRNA-Ala  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000151787  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0001  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0018  tRNA-Val  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0060  tRNA-Val  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000546078  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4302  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0357702  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0035  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.221378 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>