86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_t1816 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_t1816  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0016  tRNA-Ala  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00130891  unclonable  0.0000000248752 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1441  tRNA-Ala  92.86 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000019523  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.05432  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0047  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0008  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.594698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0055  tRNA-Ala  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0048  tRNA-Ala  90.38 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0040  tRNA-Ala  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0002  tRNA-Ala  89.09 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.22367  normal  0.0175054 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0002  tRNA-Ala  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534142 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0003  tRNA-Ala  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0411773  normal  0.562233 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0002  tRNA-Ala  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.353187  normal  0.0609648 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0002  tRNA-Ala  89.09 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0007  tRNA-Ala  88.89 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.110552  normal  0.490785 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0004  tRNA-Ala  88.89 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.155196  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAAlaVIMSS1309286  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0564631 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0038  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14002  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0011  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0025  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000185989  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0038  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59206  normal  0.592226 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0009  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0006  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0046  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.137197 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0010  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0964882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0057  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0027  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000535173  decreased coverage  0.000361063 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0016  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000587124  normal  0.11774 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0029  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.978783  normal  0.786802 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0002  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0003  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000742572  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0024  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188635  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0038  tRNA-Val  87.1 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.463505  normal  0.275868 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0046  tRNA-Val  87.93 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0191389  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0053  tRNA-Ala  87.04 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000600525 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0055  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0368844  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0025  tRNA-Ala  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000151787  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0002  tRNA-Ala  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0002  tRNA-Ala  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0054  tRNA-Ala  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127331  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0064  tRNA-Ala  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0001  tRNA-Ala  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.599986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0023  tRNA-Ala  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0065  tRNA-Ala  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0063  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0044  tRNA-Ala  86.54 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0037  tRNA-Val  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00204676  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0031  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0039  tRNA-Val  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00777868  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0034  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.884899  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0068  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.781599  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0055  tRNA-Ala  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.623624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0043  tRNA-Ala  86.54 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.734011 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0019  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000122889  normal  0.598483 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0029  tRNA-Val  89.58 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.76241 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0068  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.240621  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0043  tRNA-Ala  86.54 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0053  tRNA-Ala  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0052  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0039  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0034  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540131 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0030  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.546773  normal  0.473005 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0068  tRNA-Ala  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0550455 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0067  tRNA-Ala  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0193127 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0057  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.328689 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0027  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.987879  normal  0.104292 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0051  tRNA-Ala  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0022  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.734931  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0034  tRNA-Val  89.58 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0146998  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0012  tRNA-Ala  85.45 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000301607  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0002  tRNA-Ala  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.157867  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0022  tRNA-Val  85.71 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0746641  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0037  tRNA-Val  85.71 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0002  tRNA-Ala  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0004  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18170  tRNA-Ala  86.27 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.251001  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0021  tRNA-Val  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.824854  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0043  tRNA-Ala  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0034  tRNA-Ala  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000924303  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0028  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04940  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.669042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0035  tRNA-Ala  84.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000342792  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0026  tRNA-Val  84.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0036  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0002  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000366023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>