92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_t1831 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_t0023  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  186  6e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0167  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  186  6e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1831  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  186  6e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.399609  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0017  tRNA-Ser  93.62 
 
 		 92 bp  61.9  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0015  tRNA-Ser  93.62 
 
 		 92 bp  61.9  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0031  tRNA-Ser  93.62 
 
 		 92 bp  61.9  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.183154  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5707  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 94 bp  56  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000958315  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0078  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 92 bp  56  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000549409  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 92 bp  56  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000655937  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0601  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 94 bp  56  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000039109  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4776  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 94 bp  56  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000022881  hitchhiker  0.0000000000000230511 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0525  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 94 bp  56  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.48136e-28 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27990  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 92 bp  56  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ser-7  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 95 bp  56  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000630306  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 95 bp  56  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00887784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ser-6  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 95 bp  56  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000600892  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5672  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 92 bp  56  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000146838  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0063  tRNA-Ser  91.49 
 
 		 92 bp  54  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07713  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  50.1  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0007  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  50.1  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0166763  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0003  tRNA-Ser  89.58 
 
 		 91 bp  50.1  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000641066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0026  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  50.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.215798  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  89.36 
 
 		 88 bp  48.1  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.57943  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0002  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  48.1  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.320544  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0075  tRNA-Ser  89.58 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11590  tRNA-Ser  89.58 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0134  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.756856  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0063  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 94 bp  46.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.6315500000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0020  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000608606  hitchhiker  0.0000000136932 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2089  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.835616  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0073  tRNA-Ser  89.36 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1765  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.393275  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0004  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.155196  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0022  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0020  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.565194  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0106  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000623575 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0111  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44922  hitchhiker  0.0000655456 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0116  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0194907  hitchhiker  0.0000623575 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0043  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0613926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0038  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0030  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742423 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0021  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0717904 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0054  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 94 bp  44.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0036  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.325342  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0038  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.231561  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0010  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.216172  normal  0.054895 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t17  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0038  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0047  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.018693  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0039  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.194122  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0025  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.940611  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0005  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 95 bp  44.1  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0014  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNASerVIMSS1309365  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0016  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0046  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.26124 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0026  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0107164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4302  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0357702  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07560  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.458436  normal  0.55227 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0032  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000491895  normal  0.21046 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNASerVIMSS1309260  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNASerVIMSS1309189  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNASerVIMSS1309071  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0039  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151181 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0062  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 95 bp  44.1  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0029  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.287395  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0008  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.201006 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0033  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.985807  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNASerVIMSS1309285  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1914  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0025  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000078606  normal  0.16194 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0032  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0044  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.134546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0006  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 96 bp  44.1  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tSer02  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.111902 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0066  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00163913  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0038  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0056  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.124378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0009  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.509163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNASerVIMSS1309147  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0002  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0015  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0833  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0033  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0010  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.999563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0012  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0033  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.023989  hitchhiker  0.00746416 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0038  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0435402  hitchhiker  0.00788518 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0044  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0814997  hitchhiker  0.00838863 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.272303  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0056  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNASerVIMSS1309375  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.748623  hitchhiker  0.000994808 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>