25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_R0004 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_R0004  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.554141  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0050  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 75 bp  97.6  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0045  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 72 bp  97.6  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0028  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0101867  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0022  tRNA-Ala  92.19 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.836279  normal  0.0847494 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0003  tRNA-Ala  89.19 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0020  tRNA-Ala  95.45 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0051  tRNA-Ala  95.45 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0041  tRNA-Ala  90 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0048  tRNA-Ala  97.06 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000143033  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0039  tRNA-Ala  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0028  tRNA-Ala  90.91 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0022  tRNA-Ala  85.14 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.213128  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0057  tRNA-Ala  87.93 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0004  tRNA-Ala  87.93 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.557667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0006  tRNA-Ala  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0009  tRNA-Ala  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0015  tRNA-Ala  87.76 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.233572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0025  tRNA-Ala  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000185989  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAThrVIMSS1309299  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0668617 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0071  tRNA-Ala  85.96 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0051  tRNA-Ala  88.64 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0010  tRNA-Ala  88.64 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000307763  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0035  tRNA-Ala  86.21 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.746107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0025  tRNA-Val  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000321659  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>